La Colitis Ulcerosa es una inflamación crónica del recto y del colon, que comienza entre la tercera y cuarta década de la vida y que se presenta como diarrea acuosa y sanguinolenta, asociada a dolor abdominal, fiebre y mal estado general. La cantidad de colon y recto afectada puede variar entre los individuos con Colitis Ulcerosa, así como la intensidad de los síntomas. La colitis ulcerosa severa aguda requiere ingreso hospitalario y necesidad de cirugía  urgente en aquellos casos que no responden al tratamiento médico inicial o que sufran de alguna complicación. En la situación de enfermedad crónica, algunos pacientes pueden requerir cirugía programada (colectomías o panproctocolectomías restauradoras) si su enfermedad es refractaria a los tratamientos y además, la enfermedad crónica puede predisponer a la aparición de cáncer de colon. 

La Enfermedad de Crohn es otro proceso inflamatorio crónico del intestino, en el cual la barrera mucosa intestinal está comprometida permitiendo la invasión de bacterias intestinales. El tratamiento inicial es médico, pero la cirugía se contempla para tratar las complicaciones y mejorar la calidad de vida de los enfermos. Estas complicaciones se refieren a la aparición de fístulas, perforación y estenosis con obstrucción intestinal. Igualmente estos pacientes presentarán en el curso de su enfermedad, afectación del recto y ano apareciendo fístulas perianales complejas que requerirán cirugía.